QIAGEN選用QIAseq Targeted DNA Panel基于真邁生物測序平臺進行測試,測試結(jié)果顯示On target rate 90%,均一性表現(xiàn)佳,突變位點均可檢出,真邁生物兩個測序平臺VAF(%)?突變的檢出結(jié)果也具有很高的一致性。擴增子文庫中的common sequence區(qū)域測序質(zhì)量符合預(yù)期。
SURFSeq 5000與GenoLab M VAF(%) 相關(guān)性比較
真邁生物SURFSeq 5000測試質(zhì)量Q40數(shù)據(jù)已達到90%,錯誤率低至萬分之五(0.05%),數(shù)據(jù)質(zhì)量業(yè)界領(lǐng)先,且測序成本更低,和行業(yè)同級別測序儀相比具有顯著優(yōu)勢;GenoLab M數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異,通量靈活(18Gb-300Gb),用戶可根據(jù)相關(guān)應(yīng)用場景自由選擇合適通量。
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QIAGEN SPE(基于單端特異性引物延伸技術(shù))靶向測序方案技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)在一個反應(yīng)管中最多兼容2萬條特異性引物的PCR反應(yīng),而特異性依舊可高達90%以上。僅需一條引物結(jié)合到靶向區(qū)域即可擴增,整體擴增均一性指標 (Uniformity)?超過97%。
QIAseq FX DNA Library Kit制備的WGS文庫基于真邁生物測序平臺測序的覆蓋度、均一度等指標與其他主流平臺相當。QIAseq FX支持20 pg-1 μg的廣泛樣本起始量,無需片段化和接頭連接反應(yīng)之間進行純化,能夠不受基因序列影響,制備出具有最低G/C偏好性的基因文庫,特別適用于具有高度復(fù)雜性的各種基因組。
真邁測序平臺檢測Small RNA的性能表現(xiàn)一致
Small RNA文庫僅需SE75即可完成測序,但是考慮測序成本和便利性,一般選用PE150上機。本次測試選擇了PE150的測序方案,數(shù)據(jù)則截取R1 75bp進行分析,測試結(jié)果顯示真邁生物測序平臺miRNA檢出比例與其他主流平臺高度一致,在真邁生物不同測序平臺間,miRNA檢出比例與表達量仍具有較高的一致性。
SURFSeq 5000與GenoLab M 檢測miRNA的一致性比較
QIAseq miRNA Library Kit 是一款專為miRNA等小RNA測序分析設(shè)計的NGS解決方案,獨特的寡核苷酸處理技術(shù)極大程度降低了文庫構(gòu)建過程中接頭二聚體及其他“污染性”RNA(如hY4 RNA)的存在,無需凝膠電泳、割膠以及回收等一系列繁瑣步驟,最低起始量僅需1ng總RNA。
基于QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium的LightSpeed模塊,可助力真邁生物相關(guān)用戶以更短的運行時間進行高性價比的全基因組測序(WGS)二級分析。QCI Interpret是一個完全可定制的變異解讀方案,為腫瘤和遺傳病應(yīng)用NGS檢測的變異進行注釋和評級,目前已解讀超過300萬份報告。
QIAGEN生物信息解讀完整方案
此次合作測試,真邁生物測序平臺與QIAGEN試劑盒表現(xiàn)出高度的適配性。未來,真邁生物與QIAGEN將深化合作,發(fā)揮雙方在高通量基因測序領(lǐng)域的優(yōu)勢,為全球臨床及科研用戶提供精準高效的測序平臺、生物試劑,以及強大的數(shù)據(jù)分析與解讀系統(tǒng),持續(xù)拓寬測序應(yīng)用場景,為前沿科研探索和精準醫(yī)療提供強大支持,共同促進產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展。
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