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QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案
時間:
2024-06-27
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近日,真邁生物聯(lián)合QIAGEN(凱杰)開展基于真邁基因測序平臺SURFSeq 5000和GenoLab M,以及QIAGEN多套NGS成熟方案的測試,測試結(jié)果展現(xiàn)出真邁生物測序平臺與QIAseq NGS方案的高兼容性,即高特異性、基因組覆蓋高度均一性、以及變異檢測一致性等。雙方將以此次合作測試為契機,攜手為全球客戶提供整體NGS解決方案,以加速推進科學(xué)界基因組應(yīng)用的發(fā)現(xiàn)、提高成本效率并縮短實驗周期。


QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案

GeneMind & QIAGEN整體NGS解決方案


QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案



真邁測序平臺檢測DNA突變的性能優(yōu)秀

全面兼容丨真邁生物 SURFSeq 5000 在百邁克百創(chuàng)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)芯片兼容性測試中表現(xiàn)優(yōu)異

QIAGEN選用QIAseq Targeted DNA Panel基于真邁生物測序平臺進行測試,測試結(jié)果顯示On target rate 90%,均一性表現(xiàn)佳,突變位點均可檢出,真邁生物兩個測序平臺VAF(%)?突變的檢出結(jié)果也具有很高的一致性。擴增子文庫中的common sequence區(qū)域測序質(zhì)量符合預(yù)期。


QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案

SURFSeq 5000與GenoLab M VAF(%) 相關(guān)性比較


真邁生物SURFSeq 5000測試質(zhì)量Q40數(shù)據(jù)已達到90%,錯誤率低至萬分之五(0.05%),數(shù)據(jù)質(zhì)量業(yè)界領(lǐng)先,且測序成本更低,和行業(yè)同級別測序儀相比具有顯著優(yōu)勢;GenoLab M數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異,通量靈活(18Gb-300Gb),用戶可根據(jù)相關(guān)應(yīng)用場景自由選擇合適通量。

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QIAGEN SPE(基于單端特異性引物延伸技術(shù))靶向測序方案技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)在一個反應(yīng)管中最多兼容2萬條特異性引物的PCR反應(yīng),而特異性依舊可高達90%以上。僅需一條引物結(jié)合到靶向區(qū)域即可擴增,整體擴增均一性指標 (Uniformity)?超過97%。


真邁測序平臺檢測基因組覆蓋率表現(xiàn)優(yōu)異
全面兼容丨真邁生物 SURFSeq 5000 在百邁克百創(chuàng)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)芯片兼容性測試中表現(xiàn)優(yōu)異

QIAseq FX DNA Library Kit制備的WGS文庫基于真邁生物測序平臺測序的覆蓋度、均一度等指標與其他主流平臺相當。QIAseq FX支持20 pg-1 μg的廣泛樣本起始量,無需片段化和接頭連接反應(yīng)之間進行純化,能夠不受基因序列影響,制備出具有最低G/C偏好性的基因文庫,特別適用于具有高度復(fù)雜性的各種基因組。


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100 bp 區(qū)域的基因組覆蓋率(%)


真邁測序平臺檢測Small RNA的性能表現(xiàn)一致

全面兼容丨真邁生物 SURFSeq 5000 在百邁克百創(chuàng)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)芯片兼容性測試中表現(xiàn)優(yōu)異

Small RNA文庫僅需SE75即可完成測序,但是考慮測序成本和便利性,一般選用PE150上機。本次測試選擇了PE150的測序方案,數(shù)據(jù)則截取R1 75bp進行分析,測試結(jié)果顯示真邁生物測序平臺miRNA檢出比例與其他主流平臺高度一致,在真邁生物不同測序平臺間,miRNA檢出比例與表達量仍具有較高的一致性。


QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案

SURFSeq 5000與GenoLab M 檢測miRNA的一致性比較


QIAseq miRNA Library Kit 是一款專為miRNA等小RNA測序分析設(shè)計的NGS解決方案,獨特的寡核苷酸處理技術(shù)極大程度降低了文庫構(gòu)建過程中接頭二聚體及其他“污染性”RNA(如hY4 RNA)的存在,無需凝膠電泳、割膠以及回收等一系列繁瑣步驟,最低起始量僅需1ng總RNA。


全面的生物信息解決方案


全面兼容丨真邁生物 SURFSeq 5000 在百邁克百創(chuàng)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)芯片兼容性測試中表現(xiàn)優(yōu)異

基于QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium的LightSpeed模塊,可助力真邁生物相關(guān)用戶以更短的運行時間進行高性價比的全基因組測序(WGS)二級分析。QCI Interpret是一個完全可定制的變異解讀方案,為腫瘤和遺傳病應(yīng)用NGS檢測的變異進行注釋和評級,目前已解讀超過300萬份報告。


QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案

QIAGEN生物信息解讀完整方案


此次合作測試,真邁生物測序平臺與QIAGEN試劑盒表現(xiàn)出高度的適配性。未來,真邁生物與QIAGEN將深化合作,發(fā)揮雙方在高通量基因測序領(lǐng)域的優(yōu)勢,為全球臨床及科研用戶提供精準高效的測序平臺、生物試劑,以及強大的數(shù)據(jù)分析與解讀系統(tǒng),持續(xù)拓寬測序應(yīng)用場景,為前沿科研探索和精準醫(yī)療提供強大支持,共同促進產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展。


真邁生物

QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案

*真邁生物基因測序平臺?

詳情敬請關(guān)注真邁生物官網(wǎng)http://www.amberfitapp.com/



QIAGEN


QIAGEN為真邁生物測序平臺提供Sample to Insight完整NGS解決方案

QIAGEN產(chǎn)品詳情敬請關(guān)注QIAGEN官網(wǎng)https://www.qiagen.com/

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