真邁生物與專注于單細(xì)胞技術(shù)服務(wù)的尋因生物開展深度合作,雙方整合技術(shù)資源優(yōu)勢,共同打造了高質(zhì)量的國產(chǎn)單細(xì)胞組學(xué)整體解決方案,該方案將為推動(dòng)單細(xì)胞技術(shù)應(yīng)用和發(fā)展提供強(qiáng)有力的支持。
雙方合作開展了單細(xì)胞整體解決方案的性能評價(jià)工作,評價(jià)采用了尋因生物單細(xì)胞免疫組試劑盒構(gòu)建了多物種多組織樣本單細(xì)胞文庫,文庫樣本同時(shí)在SURFSeq 5000和NovaSeq 6000測序平臺(tái)進(jìn)行測試分析。
結(jié)果顯示,SURFSeq 5000在Clean bases ratio以及單細(xì)胞文庫質(zhì)控中的多項(xiàng)指標(biāo)均表現(xiàn)出色,其各樣本獲得read數(shù)、識(shí)別細(xì)胞數(shù)以及細(xì)胞中位基因數(shù)等指標(biāo)均優(yōu)于NovaSeq 6000。
?下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)量高,Clean bases ratio表現(xiàn)更優(yōu)
?單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)控結(jié)果優(yōu)異,且各樣本獲得read數(shù)、識(shí)別細(xì)胞數(shù)、每個(gè)細(xì)胞中位基因數(shù)等方面表現(xiàn)更優(yōu)
表2?單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)控對比結(jié)果
圖2 共享cell barcode對比結(jié)果
圖3 高變基因相關(guān)性對比結(jié)果
注:每個(gè)點(diǎn)表示一個(gè)細(xì)胞表達(dá)基因分別在SURFSeq 5000 和 NovaSeq 6000平臺(tái)中的 UMI counts 分布。
?所有基因表達(dá)量相關(guān)性達(dá)90%以上
圖4 所有基因表達(dá)量相關(guān)性對比結(jié)果
圖7 各cluster中細(xì)胞比例結(jié)果
真邁生物與尋因生物聯(lián)手打造的國產(chǎn)單細(xì)胞組學(xué)整體解決方案展現(xiàn)出了優(yōu)異的性能與可靠性,該方案可為科研人員提供高質(zhì)量的單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù),成為推動(dòng)大規(guī)模單細(xì)胞測序深入研究的重要工具。
尋因單細(xì)胞免疫組庫產(chǎn)品,立足尋因生物卓越的研發(fā)創(chuàng)新能力和品控工藝水平,致力于提供行業(yè)精準(zhǔn)數(shù)據(jù)產(chǎn)出和全流程技術(shù)服務(wù),助力免疫細(xì)胞的分化、發(fā)育和免疫識(shí)別等功能研究,在腫瘤免疫治療、感染性疾病、自身免疫疾病和疫苗/抗體研究等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景。以我所專,助您所研。
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SURFSeq 5000應(yīng)用廣泛,速度快,質(zhì)量優(yōu),成本省。它以桌面儀器成本、小樣本數(shù)量開機(jī)成本實(shí)現(xiàn)了與大型機(jī)器相媲美的高通量測序價(jià)格。真邁生物致力于持續(xù)滿足行業(yè)對測序優(yōu)化的需求,與合作伙伴深度合作,為前沿科研探索和精準(zhǔn)醫(yī)療提供強(qiáng)有力的支持。
更多關(guān)于單細(xì)胞文庫質(zhì)控參數(shù)意義解讀可通過以下連接了解:
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